Η Κεντρική Υπηρεσία Βιβλιοθήκης, με έδρα την Μυτιλήνη, είναι υπεύθυνη για τον συντονισμό και την εποπτεία της λειτουργίας των Παραρτημάτων της Βιβλιοθήκης και για τη στρατηγική ανάπτυξης της Βιβλιοθήκης.
Το Τμήμα Μηχανογράφησης, στο οποίο προΐσταται ο Βουγιούκας Παρασκευάς, έχει ως αρμοδιότητα την ανάπτυξη, υποστήριξη και διαχείριση πληροφοριακών συστημάτων για τις υπηρεσίες της Βιβλιοθήκης, της HEALLINK και τις ψηφιακές συλλογές. Επίσης αναπτύσσει, υποστηρίζει και διαχειρίζεται πληροφορικά συστήματα που σχετίζονται με την υποστήριξη λειτουργιών, υπηρεσιών και αναπτυξιακών Έργων της Βιβλιοθήκης.
