Το Τμήμα εισηγείται, σχεδιάζει και υλοποιεί εφαρμογές πληροφορικής για το διοικητικό προσωπικό του Ιδρύματος. Εξασφαλίζει την αποτελεσματική λειτουργία, συντήρηση και ασφάλεια του κεντρικού υπολογιστικού εξοπλισμού και των πληροφοριακών συστημάτων του Ιδρύματος και την διασύνδεση του με εξωτερικά πληροφοριακά συστήματα κεντρικής υποδομής της δημόσιας διοίκησης. Ενημερώνει, εκπαιδεύει και υποστηρίζει τους χρήστες των εφαρμογών λογισμικού. Συντονίζει, υποστηρίζει και εποπτεύει τα Τμήματα Πληροφορικής και Επικοινωνιών των ακαδημαϊκών μονάδων σε θέματα που αφορούν τις αρμοδιότητες του Τμήματος.