Το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών στην Εφαρμοσμένη Οικονομική και Χρηματοοικονομική, το οποίο λειτουργεί για περισσότερο από 15 χρόνια, έχει ευρεία αποδοχή από την ακαδημαϊκή κοινότητα και την αγορά εργασίας. Επιδίωξη του προγράμματος είναι η επιστημονική εξειδίκευση σε θέματα εφαρμοσμένης οικονομικής, χρηματοοικονομικής, διοικητικής επιστήμηες, οικονομικής πολιτικής και ανάπτυξης, ελεγκτικής και λογιστικής. Οι πτυχιούχοι του στελεχώνουν, μεταξύ άλλων, οικονομικά τμήματα επιχειρήσεων του ιδιωτικού και δημόσιου τομέα, τράπεζες, εταιρείες παροχής χρηματοοικονομικών υπηρεσιών, Υπουργεία, διεθνείς οργανισμούς και ελεγκτικές εταιρίες στην Ελλάδα και το εξωτερικό.
Στο πρόγραμμα γίνονται δεκτοί υποψήφιοι που διαθέτουν πτυχίο οικονομικών, νομικών, κοινωνικο-πολιτικών, θετικών επιστημών ή πολυτεχνικών τμημάτων από αναγνωρισμένα Ιδρύματα Τριτοβάθμιας Εκπαίδευσης του εσωτερικού ή του εξωτερικού.
Το Πρόγραμμα διευθύνεται και συντονίζεται από το Τμήμα Οικονομικών Επιστημών του ΕΚΠΑ και αποτελείται από 5 κατευθύνσεις εκ των οποίων οι 2 λειτουργούν αυτόνομα και σε συνεργασία με το Σώμα Ορκωτών Ελεγκτών Λογιστών (ΣΟΕΛ). Το Τμήμα Στατιστικής και Αναλογιστικών - Χρηματοοικονομικών Μαθηματικών του Πανεπιστημίου Αιγαίου συνεργάζεται στα πλαίσια του ΠΜΣ για τη λειτουργία των κατευθύνσεων
(α) Χρηματοοικονομική και Τραπεζική Οικονομική Πολιτική και Ανάπτυξη και
(β) Οικονομικά, Διοικητικά και Πληροφοριακά Συστήματα Επιχειρήσεων.
